随着机打发票的推广，基层在使用中发现发现有两大问题亟需解决：
    一是机打发票软件存在时间设置漏洞。机打发票软件安装成功之后，如果修改计算机时间，开票软件时间随之更改，那么开票日期也会更改为计算机时间。如此一来，纳税人可以随意修改开票日期。给后续的申报、征收管理带来了困难。
    二是“一机一户”的软件使用方式给推广带来阻力。近日，一名老会计兴冲冲地带着发票改版宣传资料来到大厅咨询机打发票事宜。原来，他负责着30余户从事制图、咨询业务的个体户帐目，每一户均需要开具服务业发票，以前每个月开具发票都要耗费大量的精力和时间，得知可以计算机开票以后便赶紧过来咨询。但是由于开票软件是“一机一户”的使用方式，如果他要用到机打发票便需购买30余台电脑，过高的成本将他挡在了使用机打发票的门外。